Tugas 3 Kimia Organik Semester 2
SOAL LATIHAN KARAKTERISTIK DAN ANALISIS ASAM AMINO-PROTEIN
1. Jelaskan defenisi
beberapa istilah berikut :
a) Ikatan peptide
Jawab :
Ikatan peptida merupakan ikatan yang terbentuk
ketika atom karbon pada gugus
karboksil suatu molekul berbagi elektron
dengan atom nitrogen
pada gugus amina molekul lainnya.
ikatan peptida hanya terdapat pada protein.
b) Asam Amino
N-Ujung Polipeptida
Jawab :
Asam Amino
N-Ujung Polipeptida adalah amina pada ujung protein yang terikat secara kovalen
yang spesifik pada asam amino.
c) Energi aktivasi
Jawab :
Energi aktivasi bisa juga diartikan sebagai
energi minimum yang dibutuhkan agar reaksi kimia tertentu dapat terjadi.
d) Enzim
Jawab :
enzim adalah
protein katalis yang mempercepat laju reaksi dengan cara menurunkan energi
aktivasi
e) Asam Amino
Jawab :
Asam amino adalah sembarang senyawa
organik yang memiliki gugus fungsional
karboksil
(-COOH) dan amina
(biasanya -NH2).
f) Peptida
Jawab :
Peptida
merupakan molekul yang terbentuk dari dua atau lebih asam amino .
g) Asam Amino
Esensial
Jawab :
Asam amino esensial adalah Asam amino yang
diperlukan oleh makhluk hidup sebagai penyusun protein tetapi tidak mampu
memproduksi send
h) Asam Amino
Non-Esensial
Jawab :
Asam amino non
esensial adalah asam amino yang bisa berasal dari makanan maupun dibentuk
sendiri oleh tubuh bila tubuh membutuhkannya melalui proses metabolisme tubuh.
i) Denaturasi
protein
Jawab :
Denaturasi
protein merupakan suatu proses dimana terjadi perubahan atau modifikasi
terhadap konformasi protein, lebih tepatnya terjadi pada struktur tersier
maupun
j) Substrat
Jawab :
Substrat adalah
molekul organik yang telah berada dalam kondisi siap/segera bereaksi, karena
telah mengandung promoter.
2. Tuliskan stuktur/bagian
penyusun suatu enzim!
Jawab :
1. Apoenzim, yaitu
bagian enzim aktif yang tersusun atas protein yang bersifat labil (mudah
berubah) terhadap faktor lingkungan, dan
2. Kofaktor,yaitu komponen non protein yang berupa :
a. Ion-ion anorganik (aktivator)
Berupa logam yang berikatan lemah dengan enzim, Fe, Ca, Mn, Zn,
K, Co. Ion klorida, ion kalsium merupakan contoh ion anorganik yang membantu
enzim amilase mencerna karbohidrat (amilum)
b. Gugus prostetik
Berupa senyawa organik yang berikatan kuat dengan enzim, FAD
(Flavin Adenin Dinucleotide), biotin, dan heme merupakan gugus prostetik yang
mengandung zat besi berperan memberi kekuatan ekstra pada enzim terutama
katalase, peroksidae, sitokrom oksidase.
c. Koenzim
Berupa molekul organik non protein kompleks, seperti NAD
(Nicotineamide Adenine Dinucleotide), koenzim-A, ATP, dan vitamin yang berperan
dalam memindahkan gugus kimia, atom, atau elektron dari satu enzim ke enzim
lain.
3. Tuliskan 6 golongan enzim secara
berurutan disertai fungsi aktivitasnya!
Jawab :
Oksidoreduktase yaitu golongan
enzim yang mengkatalisis pengambilan atom hidrogen dari suatu senyawa baik
dehidrogenase maupun oksidase.
Transferase yaitu enzim
yang mengkatalisis reaksi pemindahan suatu gugus dari suatu senyawa kepada
senyawa lain.
Hidrolase yaitu enzim
yang berperan sebagai katalis pada reaksi hidrolisis; baik pemecahan ester,
glikosida & peptide.
Liase yaitu enzim
yang mengkatalisis dalam reaksi pemisahan gugus dari suatu substrat (bukan cara
hidrolisis) atau sebaliknya.
Isomerase yaitu enzim
yang bekerja pada reaksi perubahan intramolekuler.
Ligase adalah enzim
yang mengkatalisis reaksi penggabungan dua molekul.
4. Tuliskan 5 jenis enzim
pencernaan disertai fungsi katalitiknya!
Jawab :
|
ORGAN
|
JENIS ENZIM
PENCERNAAN
|
FUNGSI ENZIM
PENCERNAAN
|
|
Kelenjar air
liur
|
Enzim ptialin
atau amilase
|
Mencerna
amilum menjadi maltose
|
|
Lambung
|
Pepsin
|
Mengubah
protein menjadi pepton
|
|
Renin
|
Mengubah
kaseinogen menjadi kasein
|
|
|
Pankreas
|
Tripsin
|
Mengubah
protein menjadi polipeptida
|
|
Lipase
Pankreas
|
Mengemulsikan
lemak menjadi asam lemak dan gliserol
|
|
|
Amilase
Pankreas
|
Mengubah
amilum menjadi disakarida
|
|
|
Karbohidrae
Pankreas
|
Mencerna
amilum menjadi maltose
|
|
|
Usus halus
|
maltase
|
Mengubah
maltose menjadi glukosa
|
|
laktase
|
Mengubah
laktosa menjadi galaktosa dan glukosa
|
|
|
enterokinase
|
Mengubah
tripsinogen menjadi tripsin
|
|
|
lipase
|
Mengubah
lemak menjadi gliserol dan asam lemak
|
|
|
peptidase
|
Mengubah
polipeptida menjadi asam amino
|
|
|
sukrase
|
Mengubah
sukrosa menjadi fruktosa dan glukosa
|
5. Jelaskan pengaruh pH dan Suhu
terhadap aktivitas enzim.
Jawab :
Suhu yang tinggi akan menaikkan aktivitas enzim namun sebaliknya
juga akan mendenaturasi enzim. Peningkatan temperatur dapat meningkatkan
kecepatan reaksi karena molekul atom mempunyai energi yang lebih besar dan
mempunyai kecenderungan untuk berpindah.
Pengaruh pH dalam suatu reaksi kimia, pH untuk suatu enzim tidak
boleh terlalu asam maupun terlalu basa karena akan menurunkan kecepatan reaksi
dengan terjadinya denaturasi.
6. Jelaskan pengaruh konsentrasi
enzim terhadap aktivitas enzim.
Jawab :
Peningkatan konsentrasi enzim akan meningkatkan kecepatan reaksi
enzimatik. Dapat dikatakan bahwa kecepatan reaksi enzimatik (v) berbanding
lurus dengan konsentrasi enzim [E]. Makin besar konsentrasi enzim, reaksi makin
cepat
7. Tuliskan dalam bentuk table
jenis ikatan yang dilibatkan untuk membentuk stuktur polipeptida/protein
primer, sekunder, tersier, dan quarterner.
Jawab :
|
STRUKTUR
POLIPEPTIDA
|
JENIS IKATAN
|
|
Struktur
primer
|
Ikatan
peptide
|
|
Struktur
sekunder
|
Ikatan
peptide dan ikatan hydrogen
|
|
Struktur
tersier
|
Ikatan
peptide, ikatan hydrogen, dan ikatan rantai samping (ion/kovalen)
|
|
Struktur
kuartener
|
Ikatan antara
tersier dan tersier
|
8. Isilah titik-titik dalam kolom fungsi
protein di bawah ini :
Jawab :
|
No
|
Fungsi Protein
|
Jenis protein
|
|
1
|
Penyusun stuktur sel kulit
|
Kolagen
|
|
2
|
membantu pencernaan dengan memecah molekul kompleks seperti
pati dan protein masing-masing, menjadi lebih sederhana, sehingga mereka
dapat diserap oleh usus kecil.
|
Enzim amilase dan pepsin
|
|
3
|
hormon yang merangsang kontraksi selama persalinan. Insulin
mengatur glukosa dalam darah.
|
oksitosin
|
|
4
|
menyimpan besi dan mengontrol jumlah yang hadir besi dalam
tubuh manusia.
|
ferritin
|
|
5
|
membawa oksigen ke paru-paru dan berbagai sel dalam tubuh
manusia
|
Hemoglobin
|
|
6
|
membantu transportasi lipid atau lemak
|
lipoprotein
|
9. Klasfikasikan 20 jenis
asam amino ke dalam table golongan rantai samping asam amino berikut ini :
|
No
|
Golongan
Rantai Samping
|
Jenis protein
|
|
1
|
Asam amino
non polar
|
-
1. Glisin
-
2. Alanin
-
3. Valin
-
4. Leusin
-
5. Isoleusin
-
6. Proline
|
|
2
|
Asam amino
polar
|
-
1. Serin
-
2. Threonin
-
3. Sistein
-
4. Metionin
-
5. Asparagin
-
6. Glutamine
|
|
3
|
Asam amino
bersifat asam
|
-
1. Asam aspartat
-
2. Asam glutamat
|
|
4
|
Asam amino
bersifat basa
|
-
1. Lisin
-
2. Arginin
-
3. Histidin
|
|
5
|
Asam amino
aromatik
|
-
1. Fenilalanin
-
2. Tirosin
-
3. Triptofan
|
10. Tuliskan fungsi dari 3 peptida sederhana berikut
ini :
a) Insulin
Jawab :
yaitu membuka
jalan agar glukosa dapat masuk ke dalam sel untuk menghasilkan energi, menekan
produksi gula di hati dan otot, serta mencegah pemecahan lemak sebagai sumber
energi.
b) Vasopresin
Jawab :
meningkatkan
reabsorbsi air dari tubulus renal kembali ke dalam darah, dan karena itu akan
membantu mengatur volume cairan tubuh. Hal tersebut merupakan
alas an vasopressin mendapat sebutan lain sebagai hormone antidiuretik.
c) Glukagon
Jawab :
glukagon sangat
penting untuk respon tubuh terhadap kekurangan makanan. Misalnya, mendorong penggunaan
lemak yang tersimpan untuk energi dalam rangka melestarikan terbatasnya pasokan
glukosa.
11. Insulin merupakan suatu peptide yang tersusun atas 2
rantai peptide. Gambarkan struktur molekul pembentukan ikatan peptide rantai A
insulin yang tersusun atas 21 jenis asam amino. Kemudian berikan penamaannya.
Jawab :
12. Jelaskan perbedaan reaksi edman dan reaksi sanger
Jawab :
Reaksi sanger
adalah reaksi antara gugus α-amino dengan 1-fluoro-2-,4-dinitrobenzena (FDNB).
Dalam keadaan basa lemah, FDNB bereaksi dengan α-asam amino menghasilkan
derivat 2,4-dinitrofenil atau DNP-asam amino untuk menentukan N-ujung
suatu polipeptida sedangkan reaksi edman merupakan reaksi antara α-asam amino
dengan fenilisotiosianat yang menghasilkan derivat asam amino feniltiokarbamil.
Dalam suasana asam pelarut nitrometana yang terakhir ini mengalami siklisasi
membentuk senyawa lingkar feniltuihidantoin. untuk menentukan N-ujung terminal
asam amino penyusun suatu polipeptida
13. Jelaskan fungsi reaksi ninhidrin
Jawab :
Reaksi
ninhidrin untuk menunjukkan adanya asam amino dalam sampel zat yang diuji.
14. Tuliskan 3 jenis reaksi uji spesifik rantai samping
asam amino.
Jawab :
Reaksi Edman
Reaksi Sanger
Reaksi Dansil
Klorida
15. Tuliskan 3 tahapan utama analisis kadar protein metode
kjehdal disertai reaksi kimia yang berlangsung dari setia tahapan.
Jawab :
16. Jelaskan secara singkat prinsip analisis kadar protein
dengan metode Lowry.
Jawab :
Reduksi
Cu2+ menjadi Cu+ oleh asam amino aromatik dalam protein. Ion Cu+
bersama dengan Fosfotungsat dan Fosfomoblidat dalam reagen Fenol membenuk warna
biru sehingga dapat menyerap cahaya dan dapat diamati secara
spektrofotomentri.
17. Jika pada suatu analisis protein metode kjehdal ditimbang
sampel 1,5 gram. Setelah melalui 3 tahapan utama prosedur diperoleh volume
titrasi blanko 0,2 mL dan volume titrasi sampel 5,7 mL. Hitunglah kadar protein
dalam sampel!
Jawab :
